前身

日本臨床検査医学会の前身である臨床病理懇談会は，橋本寛敏，坂口康蔵，加藤勝治，緒方富雄の発起により，臨床検査の問題，とくに病院における臨床検査の位置，役割を検討，改良することを中心に話し合うことを目的に1951（昭和26）年11月20日に設立され，橋本寛敏が初代会長に就任した．臨床病理懇談会は，1953（昭和28）年まで年4回開催された．

1951（昭和26）年11月	事務所開設：国立東京第一病院（現 国立国際医療研究センター 東京都新宿区戸山1-21-1）
1953（昭和28）年1月	会誌「臨床病理」を発刊．

臨床病理学会

1953（昭和28）年12月	第9回臨床病理懇談会において臨床病理学会と改称．
1954（昭和29）年10月	第1回臨床病理学会総会を東京大学医学部で開催．

日本臨床病理学会

1955（昭和30）年11月	第2回臨床病理学会総会において日本臨床病理学会と改称．
1957（昭和32）年	国際臨床病理学会（ISCP）に加盟．
1964（昭和39）年	事務所移転：順天堂大学医学部（東京都文京区本郷3-1-3）
1971（昭和46）年	小酒井望が第2代会長に就任．
1976（昭和51）年	日本医学会に加盟．
1979（昭和54）年	認定臨床検査医制度が発足．
1983（昭和58）年10月	小酒井望が会長，河合忠が事務局長を務め，アジアで初めて東京で第12回世界臨床病理学会議を開催． 常陸宮殿下にご臨席賜った．
1985（昭和60）年	事務所移転（東京都文京区本郷2-11-10）
1986（昭和61）年	河合忠が第3代会長に就任．
1990（平成2）年6月	佐々木禎一，黒川一郎が会長を務め，札幌で第1回アジア臨床病理学会議を開催．
1991（平成3）年	河合忠がアジアで初めて世界病理学会連合（WASP）第14代presidentに就任．
1992（平成4）年	河野均也が第4代会長に就任．
1998（平成10）年	櫻林郁之介が第5代会長に就任．

日本臨床検査医学会

2000（平成12）年11月	第47回日本臨床病理学会総会において日本臨床検査医学会と改称．
2001（平成13）年1月	事務所移転（東京都千代田区猿楽町1-7-1）
2001（平成13）年	森三樹雄が世界病理・臨床検査医学会連合（WASPaLM）第19代presidentに就任．
2004（平成16）年	渡辺清明が第6代会長に就任．
2006（平成18）年2月	日本臨床検査医学会有限責任中間法人を設立．渡辺清明が理事長に就任．
2006（平成18）年10月	熊谷俊一が会長を務め，神戸で第9回アジア臨床病理・臨床検査医学会議を開催．
2007（平成19）年4月	事務所移転（東京都千代田区神田小川町2-2）
2008（平成20）年	宮澤幸久が第7代理事長に就任．
2008（平成20）年12月	一般社団法人日本臨床検査医学会に移行．
2012（平成24）年	村田満が第8代理事長に就任．
2012（平成24）年11月	高橋伯夫が会長を務め，京都で第12回アジア臨床病理・臨床検査医学会議を開催．
2015（平成27）年	村上正巳が世界病理・臨床検査医学会連合（WASPaLM）第26代presidentに就任．
2016（平成28）年	矢冨裕が第9代理事長に就任．
2017（平成29）年11月	村上正巳が会長，山田俊幸が事務局長を務め，京都で第29回世界病理・臨床検査医学会議を開催． 三笠宮彬子女王殿下にご臨席賜った．
2020（令和2）年	村上正巳が第10代理事長に就任．
2021（令和3）年1月	機関誌の名称を「臨床病理」から「日本臨床検査医学会誌」に変更．
2022（令和4）年3月	大西宏明が第11代理事長に就任．
2022（令和4）年10月7日（金）～10月9日（日）	宮地勇人が会長を務め，神戸で第17回アジア臨床病理・臨床検査医学会（ASCPaLM）を開催．
2022（令和4）年12月28日（水）	国際誌（Laboratory Medicine International）を発刊．